En el GEC llevamos adelante distintos proyectos de investigación en Genómica, Metagenómica y Transcriptómica. Las principales áreas de estudio son:
CARACTERIZACIÓN DEL MICROBIOMA HUMANO, ANIMAL Y AMBIENTAL
El microbioma es el conjunto de microorganismos y virus que co-existen en cada ambiente de la Tierra, desde el fondo del océano hasta la piel humana. Los microbiomas son ecosistemas dinámicos y complejos constituidos por cientos a miles de miembros. En los seres vivos, existe un microbioma característico en los diferentes sitios corporales, conviviendo en la mayoría de los casos en una relación simbiótica comensal con el hospedador participando en funciones vitales. Su capacidad biotransformadora puede impactar desde la salud de los organismos vivos, el ambiente en el que están inmersos, hasta en las características fisicoquímicas de materiales utilizados en entornos productivos. Es por ellos que en el GEC nos enfocamos en el estudio de microbiomas, su rol ambiental y factores estratégicos para su modulación.
ARNs NO CODIFICANTES Y SU ROL EN LA COMUNICACIÓN INTER-REINO
Los microorganismos simbiontes humanos superan en número a nuestras células y se estima que expresan 100 veces más genes que los presentes en nuestro genoma, manteniendo una comunicación estrecha con el hospedador. Hoy sabemos que esta comunicación “inter-reino” es mediada, al menos en parte, por microvesículas y que la presencia de estos organismos en diversos nichos corporales puede modularse por factores ambientales. Entre las microvesículas de tamaño nanométrico conocidas se encuentran los exosomas, que desempeñan un papel fundamental en la comunicación de célula a célula mediada por ARNs, especialmente en procesos inflamatorios y malignos. Estudiar la dinámica de expresión de ARNs no codificantes en distintos contextos biológicos, propone definir estrategias diagnósticas personalizadas, así como traer luz a mecanismos de interacción microbiota-hospedador mediados por ANRs no codificantes.
Adicionalmente nos encontramos trabajando en colaboración con diferentes proyectos interdisciplinarios:
- Búsqueda de nuevos biomarcadores asociados al ecosistema microbiano oral como predictores de respuesta a tratamiento biológico en psoriasis severa. Lena Eimer, Hospital Universitario Austral.
- Secuenciación de 3ra generación para discriminar eventos de reinfección vs reactivación del virus de papiloma humano y su relación con el microbioma vaginal. Carolina Maya, Hospital Universitario Austral.
- Aportes metagenómicos y metatranscriptómicos en Colitis Ulcerosa: búsqueda de herramientas integrales de diagnóstico y seguimiento. Dra. Claudia Fuxman. Hospital Universitario Fundación Favaloro (HUFF).
- Organización dedicada a la prestación de servicios analíticos, de tecnología y de asistencia técnica para las industrias de alimentos, de energía y de ambiente . Dr. Juan Martín Oteiza. CIATI.
- Latinbiota: comprendiendo la evolución, transmisión y resistencia a antibióticos de patógenos asociados a la microbiota en países de Latinoamérica. Dr. Gregorio Iraola. Wellcome Sanger Institute.
- Estudio del microbioma intestinal y su asociación con el hígado graso no alcohólico en Argentina – Dra. Julieta Trinks. Hospital Italiano
- Biomarcadores metabolómicos fecales y plasmáticos y su asociación con el hígado graso no alcohólico en Argentina. Dra. Julieta Trinks. Hospital Italiano
- Glicobiología y comunicación inter-reino en enfermedades inflamatorias intestinales en población Argentina. Dra. Karina Mariño. IBYME-CONICET
- Relevancia del microbioma en tejido tumoral de pacientes con cáncer de mama temprano. Dra. Vivian Labovsky. IBYME-CONICET
- Microvesículas de bacterias lácticas como encapsulantes de moléculas bioactivas para enriquecer un alimento bebible en base a quinoa, nutricionalmente recomendado para adultos mayores. Dr. Federico Coluccio Leskow. PECSI-UNLU
- Búsqueda de Biomarcadores Moleculares en Enfermedad Celíaca. Dr. Mauricio De Marzi. INEDES-CONICET-UNLU
- Análisis metagenómico en biofilms de ecosistemas acuáticos sometidos a contaminación por As y su efecto en Cnesterodon decemmaculatus (Poeciliidae, Cyprinodontiformes). Dra. Bettina Eissa. INEDES-CONICET-UNLU
- Plataforma para el diagnóstico y prevención de enfermedades en animales de importancia productiva: metagenómica de peces (salmónidos y tilapia) y bovinos. Dr. Maximiliano Wilda-CEVAN-CONICET
- Análisis bioinformático de RNA-seq: una perspectiva para plantas medicinales. Dra. Sabrina Costa Tartara -INTA-CONICET